党政办公室
负责综合协调、工作计划、总结和日常事务处理、文秘、保密、信息、档案、情报资料、图书资料、统计、人员考核、培训、奖惩、晋升、聘任、退休人员管理、党务、纪检、审计及工、青、妇和计划生育工作；负责财务、基建维修、车辆、安全保卫、生活服务、物资供应等后勤保障工作。

综合管理科
负责受理食品、公共场所、化妆品、涉水产品、消毒产品等健康相关产品、医疗广告卫生许可的申请、审核、发证，并提供咨询服务；受理投诉、举报，负责行政处罚一般程序和听证程序的处罚案件的资料审查，询问调查，接受陈述申辨，提出行政处罚建设，执行行政处罚决定；处理突发事件。

监督一科
负责食品、涉水产品、消毒产品等卫生监督，参与食物中毒及食物污染事故的调查处理。

监督二科
负责公共场所、学校卫生、劳动卫生、化妆品卫生监督，对卫生污染、中毒事故进行现场控制和行政处理。

监督三科
负责传染病防治、放射卫生监督、医疗机构监管、医疗广告审核、上报及突发事件的处理。